在水体底部生态修复过程中，生物多样性的恢复被认为是水体底部生态修复效果的重要指标之一。生态系统恢复工作的目标是使退化的环境恢复到与原始状态相似的状态。研究表明，水生植被可以在三个月内显着改善湿地沉积物中的细菌群落结构和特定酶活性。
综述了沉水植物在改善城市水沙中的研究进展，重点关注沉水植物在城市水沙修复过程中的氧化还原特性、污染物去除率和生态重建等方面的好处。但是，沉水植物在城市水体整治中的应用还存在很多问题需要注意：
（1）沉水植物修复水体的效率和工艺参数不明确；泥浆修复对水体和沉积物的理化性质和生境改善效果尚不清楚，沉积物和水体的DO和OKP变化、吸收净化效率值、吸附和微生物协同净化等一系列工艺参数效率和边界条件仍然是空白。 .
(2) 常用的沉水植物耐环境冲击性较弱。沉水植物抗污染负荷、水力冲刷、抗低温能力较弱，在合流、溢流污染较大的水体中不易生存。在北方地区，越冬能力较差，如果植物死亡，如果不进行有效抢救，内源性污染将进一步增加。
(3)修复过程缓慢。由于缺乏合适的电子供体或受体，微生物活性有限，植物-微生物协同修复过程相对缓慢，周期长，应用效果不理想。
（4）植物、微生物或功能材料修复水体的研究较多，多集中于水质改善的研究，而水体与沉积物联合修复的研究较少。植物-微生物功能关于恢复水体和沉积物的材料功效的报告甚至更少见。